František Tondra se narodil 4. června  1936 ve Spišských Vlaších. Maturoval na jedenáctileté  střední  škole ve Spišské Nové Vsi (1954). V letech 1954 – 1957 studoval na Vysoké škole pedagogické v Bratislavě a v letech 1957 – 1962 na Římskokatolické Cyrilometodějské bohoslovecké fakultě v Bratislavě, kde v roce 1978 získal doktorát z teologie. Na místní  katedře morální teologie působil v letech  1978 – 1983 jako odborný asistent. V roce 1990 se stal odborným asistentem na na Teologickém institutu  CMBF UK a TF KU ve Spišské Kapitule - Spišském Podhradí. V červenci  1993  získal habilitaci a v prosinci  1997 byl jmenovaný profesorem v oboru  teologie.

Na kněze byl vysvěcen 1. července 1962 v Bratislavě.   26. července 1989 byl jmenován diecézním  biskupem spišské diecéze. Konsekrovaný byl 9. září 1989 v Katedrále sv. Martina v Spišském Podhradí. Světitelem byl kardinál Jozef Tomko.

Od 3. 10. 1994 působil jako konzultor Kongregace pro katolickou výchovu. V dubnu 1990 byl jmenován místopředsedou  Biskupské konference ČSFR. V červenci 1991 se po abdikaci kardinála Tomáška stal předsedou  Biskupské konference ČSFR. V květnu 1993, po rozpadu ČSFR, byl jmenován předsedou Konference biskupů Slovenska (kvůli nemoci se této funkce vzdal 13. 4. 1994); byl však znovu zvolen 31. 8. 2000 a jako předseda působil až do 28.10. 2009.

V srpnu minulého roku se zřekl  úřadu spišského diecézního biskupa, Svatý otec Benedikt XVI. ho poté ustanovil jako apoštolského administrátora spišské diecéze. Od září 2011 byl v důchodu. Na začátku dubna  2012 byl hospitalizovaný ve Východoslovenském ústavu srdcových a cévních onemocnění v Košicích, kde se podrobil operaci srdce. Zemřel 3. května 2012 po těžké nemoci v košické nemocnici.