Křesťanství se zpočátku od časů sv. Františka Xaverského v Japonsku šířilo bez větších překážek. První skutečné pronásledování propuklo na samém sklonku 16. stol. Jeho obětmi byli křesťané japonského i evropského původu, kněží, řeholníci i laici.
Podezření japonských vládců mělo několik příčin: jezuitští misionáři odmítli poskytnout loď pro vojenskou invazi do Koreje, mladé křesťanky (zvláště ty, které se rozhodly pro zasvěcený život) zase nehodlaly připojit se k císařskému harému. K tomu se připojila rostoucí obava, že působení evropských misionářů jen připravuje půdu pro španělskou invazi, při níž křesťané poslouží jako „pátá kolona“.
8. listopadu 1596 byl vydán císařský dekret, který přikazoval zatknout všechny řeholníky v působnosti guvernérů Osaky a Miyaka. Na počátku následujícího roku byli zatčeni tři jezuité, šest františkánů a sedmnáct jejich spolupracovníků. Byli deportováni do Nagasaki, kde byli ukřižováni. Stojí za to připomenout si jejich jména:
Pavel Miki, jezuita
Jan z Goto Soan, jezuita
Jakub Kisai, jezuita
Pedro Bautista Blázquez, františkán
Martin od Nanebevstoupení Aguirre, františkán
František Blanco, františkán
Filip od Ježíše de Las Casas, františkán
Gonsalvo García, františkán
František od Sv. Michala de la Parilla, františkán
Leo Karasuma, laický katecheta
Petr Sukejiro, laický katecheta
Kosma Takeja, laický katecheta
Pavel Ibaraki, laický katecheta
Tomáš Dangi, laický katecheta
Pavel Suzuki, laický katecheta
Ludvík Ibaraki, nově pokřtěný
Antonín, nově pokřtěný
Michael Kozaki a jeho syn Tomáš, nově pokřtění
Bonaventura, nově pokřtěný
Gabriel, nově pokřtěný
Jan Kinuya, nově pokřtěný
Matěj, nově pokřtěný
František z Meaka, nově pokřtěný
Jáchym Sakakibara, nově pokřtěný
František Adauctus, nově pokřtěný
zdroj: santiebeati.it